《本草纲目》以其继往开来的卓越成就迅即为医药学界赞赏推崇,金陵初刊后不到7年,就在江西刊刻了第二版。《本草纲目》52卷共收载药物1892种,绘制药物图1109幅,附方11096首。所收药物以其天然来源及属性为纲,分为16部；在同一部下,则以相近之类别为目,更分为60个类目,条分缕析,一目了然。他的药物分类法在前人基础上作出了创造性贡献,有着相当高的科学价值。例如其所收的1094种植物药,是根据其根、茎、叶、花、果的特点,及其性味、形态、生长环境、习性与人类生活的关系等因素,加以综合分析、归纳比较进行区分的。
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